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¿Qué es Blast y para qué sirve?
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) es un programa informático de alineamiento de secuencias de tipo local, ya sea de ADN, ARN o de proteínas. El BLAST es la herramienta más usada para la anotación y predicción funcional de genes o secuencias proteicas.
¿Qué Suposicion hace Blast?
El programa BLAST encuentra regiones de similitud local entre la secuencia de ADN de un usuario y las secuencias de la base de datos de GenBank. Tal similitud sugiere homología, la existencia de ascendencia compartida entre los genes.
¿Qué significa BLAST NCBI?
BLAST es el acrónimo de Basic Local Alignment Search Tool. Fué desarrollado por Altschul en 1990 y es el algoritmo mas empleado por el NCBI. La principal característica del BLAST es su velocidad, pudiendo tomar pocos minutos cualquier búsqueda en la totalidad de la base de datos.
¿Qué es el primer BLAST?
La herramienta bioinformática, Primer-BLAST, fue diseñada con la opción de analizar secuencias de iniciadores reportados en la literatura de una manera amigable.
¿Qué significa Max score en Blast?
Max score: Es el score de la mejor secuencia alineada. Total score: Es la suma de los scores de todas las secuencias alineadas.
¿Cuándo se creó Blast?
¿Qué significa Max score en BLAST?
¿Cuándo se creó BLAST?
¿Qué es el primer-Blast y para qué sirve?
Primer-BLAST: A partir de una secuencia de entrada se diseñan primers de PCR con Primer3. Luego los primers diseñados se analizan con Blast contra una base de datos seleccionada por el usuario para evitar que se diseñen que amplifiquen secuencias distitnas de la original.
¿Qué es la aplicación local de Blast?
La aplicación local de BLAST tiene la ventaja de que permite manejar varios parámetros que en las búsquedas de NCBI están estandarizados, por lo que provee una mayor flexibilidad para los usuarios avanzados. 1.1 Primera etapa: ensemillado o seeding.
¿Cuáles son los errores de anotación de Blast?
A pesar de que BLAST es un programa muy poderoso y casi siempre podemos confiar en sus resultados, se debe recordar que el programa es heurístico y por lo tanto puede que no encuentre la solución óptima. En la actualidad, el abuso y la pobre interpretación de los resultados de BLAST ha llevado a múltiples errores de anotación.
¿Qué es el resultado del Blast?
El resultado del BLAST se divide en varias secciones. En la primera se nos informa sobre la versión del programa utilizado, el nombre de la base de datos y el número de secuencias buscadas. A continuación aparecen una figura y una tabla con un resumen de los resultados.
